Gioiello del borgo medievale di Carmine Superiore è la chiesa trecentesca di San Gottardo, dedicata al vescovo sassone che forse soggiornò proprio qui durante un viaggio verso Roma. Costruita in due tempi successivi, una prima fase dal 1332 al 1401, una seconda conclusasi nel 1431. La chiesa presenta i due corrispondenti corpi di fabbricato facilmente riconoscibili perchè collocati su due diversi livelli uniti tra loro da alcuni gradini. Consacrata dal cardinale Carlo Borromeo nel 1574, la chiesa fu tenacemente voluta dagli abitanti di Carmine che non volevano più essere obbligati a recarsi a Cannobio per seguire le sacre celebrazioni. Sa Gottardo è un vero e proprio scrigno di tesori artistici di grande pregio, datati tra il XV e il XVI secolo. Tanto all'interno quanto sulle pareti esterne di possono ammirare diversi affreschi in gran parte attribuiti al "Maestro di carzoneso", pelopiù raffiguranti scene bibliche. 

Importanti restauri avvenuti nel 1932-1933 e dal 1997 al 2002 hanno permesso di riportare all'antico splendore i preziosi cicli di affreschi. Due trittici cinquecenteschi attribuiti uno a Battista da Legnano e l'altro a Giovanni Battista de priori e Galdino da Varese sono stati trasferiti, per motivi di sicurezza, nella chiesa di San Vittore a Cannobio.